"Bug a Boo" xuất hiện tại vị trí #87 trên bảng xếp hạng Billboard Hot 100 vào ngày 25 tháng 9 năm 1999 và sau đó nằm ở vị trí #33 trước ca khúc bị kéo xuống trong bảng xếp hạng. Sau thành công lớn của "Bills, Bills, Bills", "Bug a Boo" khá thất bại về mặt doanh thu và những yêu phát thanh trên đài. Nhưng ca khúc khá thành công trên bảng xếp hạng R&B với vị trí #15, nhưng lại trở thành một trong hai ca khúc không leo lên top 10 của nhóm trên bảng xếp hạng này. Đây đồng thời cũng chính là đĩa đơn thất bại trên các bảng xếp hạng tại Hoa Kỳ và những vẫn dành 20 tuần trên bảng Hot 100. Từ khi có sự xuất hiện của bản "Refugee Camp Remix", ca khúc lại tiếp tục thành công như lời mở đầu của ca khúc "trong lần thứ hai này chúng tôi sẽ thành công". Đĩa đơn đơn đứng vị trí #26 trên bảng xếp hạng Australian ARIA Singles Chart. Đây chính là đĩa đơn kém thành công nhất chỉ sau "Girl" vào năm 2004.

Tại Hà Lan, ca khúc giành vị trí thứ 6 trên bảng xếp hạng Mega Single Top 100, ca khúc nằm trong bảng xếp hạng 15 tuần và giành rất nhiều lần phát sóng trên các đài phát thanh.

Bảng xếp hạng